中国船长被捕后搭乘“水城”号巡视船于8号上午7点25分到达日本冲绳?石垣港口，随后被石垣海上保安部的车子带走接受调查。中国渔船上另外14名船员则是同搭乘的中国渔船一起，在日本保安部水警的监视下向冲绳-石垣港进发，预计将于傍晚左右到达港口。据悉，日本该保安部相关人员表示将会对中国渔船的情况进行勘察，并且会依据调查需要对船上人员进行问讯。

　　日本保安厅称此次逮捕中国船长的理由是，其涉嫌于9月7日上午10点56分左右，在尖阁诸岛（中国称“钓鱼群岛”）的久场岛（中国称为“黄尾屿”）西北约15公里处日本领海海域内不接受对其进行追踪的“水城”号巡视船的停船命令，并突然转舵，导致“水城”号与中国渔船发生碰撞。而这一行为已经妨碍了日本保安厅海上保安官执行公务。

　　另外据日本方面称，在中国渔船与“水城”号巡视船发生碰撞之前的40分钟左右，在钓鱼岛西北约12公里处的日本领海已经与一艘名为“与那国”的巡视船发生了碰撞。当时，“与那国”号发现中国渔船存在违法从事海上捕鱼作业的嫌疑，正欲靠近以催促其离开。